此包适用于Bioconductor 3.14版;有关稳定的最新发布版本,请参见π.
Bioconductor版本:3.14
优先级指数(Pi)是一种基因组主导的目标优先级系统。它整合了功能基因组预测器、网络连接知识和免疫本体论,在基因和通路水平上优先考虑潜在的药物靶点。
作者:方海,ULTRA-DD财团,Julian C Knight
维护者:Hai Fang
引文(从R内,输入引用(“π”)
):
要安装此包,请启动R(版本“4.1”)并输入:
如果(!require("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")
对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放.
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“π”)
超文本标记语言 | R脚本 | Pi用户手册(R/Bioconductor包装) |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | GeneExpression,GeneTarget,遗传学,GenomeWideAssociation,GraphAndNetwork,嗝,LinkageDisequilibrium,网络,通路,软件 |
版本 | 2.6.0 |
在Bioconductor | BioC 3.4 (R-3.3)(5.5年) |
许可证 | GPL-3 |
取决于 | igraph,dnet,ggplot2、图形 |
进口 | 矩阵,GenomicRanges,GenomeInfoDb,supraHex,尺度grDevices,ggrepel,ROCR,randomForest,glmnet,晶格,脱字符号,plot3D,统计,方法,质量,IRanges,BiocGenerics,dplyr,tidyr,ggnetwork,osfr,RCircos,purrr,readr,宠物猫 |
链接 | |
建议 | foreach,doParallel,BiocStyle,knitr,rmarkdown,png,GGally,gridExtra,ggforce,fgsea,RColorBrewer,ggpubr,rtracklayer,ggbio,Gviz,data.tree,jsonlite |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | http://pi314.r-forge.r-project.org |
BugReports | https://github.com/hfang-bristol/Pi/issues |
全靠我 | |
进口我 | |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
源包 | Pi_2.6.0.tar.gz |
Windows二进制 | Pi_2.6.0.zip |
macOS 10.13 (High Sierra) | Pi_2.6.0.tgz |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/Pi |
源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:packages/Pi |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/Pi/ |
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