π

DOI:10.18129 / B9.bioc.Pi

此包适用于Bioconductor 3.14版;有关稳定的最新发布版本,请参见π

利用遗传证据在基因和通路水平优先选择药物靶点

Bioconductor版本:3.14

优先级指数(Pi)是一种基因组主导的目标优先级系统。它整合了功能基因组预测器、网络连接知识和免疫本体论,在基因和通路水平上优先考虑潜在的药物靶点。

作者:方海,ULTRA-DD财团,Julian C Knight

维护者:Hai Fang

引文(从R内,输入引用(“π”)):

安装

要安装此包,请启动R(版本“4.1”)并输入:

如果(!require("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“π”)

超文本标记语言 R脚本 Pi用户手册(R/Bioconductor包装)
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews GeneExpressionGeneTarget遗传学GenomeWideAssociationGraphAndNetworkLinkageDisequilibrium网络通路软件
版本 2.6.0
在Bioconductor BioC 3.4 (R-3.3)(5.5年)
许可证 GPL-3
取决于 igraphdnetggplot2、图形
进口 矩阵GenomicRangesGenomeInfoDbsupraHex尺度grDevices,ggrepelROCRrandomForestglmnet晶格脱字符号plot3D,统计,方法,质量IRangesBiocGenericsdplyrtidyrggnetworkosfrRCircospurrrreadr宠物猫
链接
建议 foreachdoParallelBiocStyleknitrrmarkdownpngGGallygridExtraggforcefgseaRColorBrewerggpubrrtracklayerggbioGvizdata.treejsonlite
SystemRequirements
增强了
URL http://pi314.r-forge.r-project.org
BugReports https://github.com/hfang-bristol/Pi/issues
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包 Pi_2.6.0.tar.gz
Windows二进制 Pi_2.6.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra) Pi_2.6.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/Pi
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:packages/Pi
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/Pi/
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