PharmacoGx

DOI:10.18129 / B9.bioc.PharmacoGx

这个包是3.14版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅PharmacoGx

大规模药物基因组学数据分析

Bioconductor版本:3.14

包含一组函数执行大规模pharmaco-genomic数据的分析。这些包括PharmacoSet对象用于存储药物基因组学实验的结果,以及大量的函数计算常见的药物剂量反应和总结相关癌症细胞系的分子特性。

作者:切赫斯米尔诺夫(aut) Zhaleh Safikhani (aut),克里斯托弗•伊尔斯(aut)马克·弗里曼(aut),本杰明Haibe-Kains (aut (cre)

维护人员:本杰明Haibe-Kains < benjamin.haibe。实物地租在utoronto.ca >

从内部引用(R,回车引用(“PharmacoGx”)):

安装

安装这个包,开始R(版本“4.1”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“PharmacoGx”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放

文档

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browseVignettes (“PharmacoGx”)

PDF R脚本 创建一个PharmacoSet对象
PDF R脚本 PharmacoGx: R包大的药物基因组学数据集的分析
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews 分类,GeneExpression,遗传药理学,药物基因组学,软件
版本 2.6.0
Bioconductor自 BioC 3.4 (r - 3.3)(5.5年)
许可证 艺术- 2.0
取决于 R (> = 3.6),CoreGx
进口 BiocGenerics,Biobase,S4Vectors,SummarizedExperiment,MultiAssayExperiment,BiocParallel,ggplot2,magicaxis,RColorBrewer平行,caTools、方法、下载器,统计,跑龙套,图形、grDevicesreshape2,jsonlite,data.table,胶水,使彻底失败
链接
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SystemRequirements
增强了
URL
BugReports https://github.com/bhklab/PharmacoGx/issues
取决于我
进口我 Xeva
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包档案

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源包 PharmacoGx_2.6.0.tar.gz
Windows二进制 PharmacoGx_2.6.0.zip
macOS 10.13(高山脉) PharmacoGx_2.6.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/PharmacoGx
源库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/ PharmacoGx
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/PharmacoGx/
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