PADOG

DOI:10.18129 / B9.bioc.PADOG

这个包是3.14版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅PADOG。

重叠基因的途径分析重量降低(PADOG)

Bioconductor版本:3.14

这个方案实现了一套通用基因分析方法称为PADOG轻视基因的重要性往往横跨天际的基因进行分析。包还提供了一组基准基因分析方法的灵敏度和排名使用公共数据集从KEGGdzPathwaysGEO包24。

作者:Adi Laurentiu Tarca < atarca med.wayne.edu >;辉徐<辉。徐:gmail.com >

维护人员:Adi l . Tarca < atarca med.wayne.edu >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.1”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“PADOG”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“PADOG”)

PDF	R脚本	PADOG
PDF		参考手册

细节

biocViews	微阵列,OneChannel,软件,TwoChannel
版本	1.36.0
Bioconductor自	BioC 2.11 (r - 2.15)(9.5年)
许可证	GPL (> = 2)
取决于	R (> = 3.0.0),KEGGdzPathwaysGEO、方法、Biobase
进口	limma,AnnotationDbi,GSA,foreach,doRNG,hgu133plus2.db,hgu133a.db,KEGGREST,nlme
链接
建议	doParallel、并行
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我	BLMA
进口我	EGSEA
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	PADOG_1.36.0.tar.gz
Windows二进制	PADOG_1.36.0.zip(32位和64位)
macOS 10.13(高山脉)	PADOG_1.36.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/PADOG
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ PADOG
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/PADOG/
包下载报告	下载数据