Oscope

DOI:10.18129 / B9.bioc.Oscope

这个包是3.14版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅Oscope。

Oscope——统计管道识别振荡在同步的单细胞RNA-seq基因

Bioconductor版本:3.14

Oscope是统计管道开发识别和恢复基本周期的振荡基因在非同步单细胞RNA-seq实验。Oscope管道包括三个模块:一个正弦模型模块搜索候选人振荡器对;K-medoids集群模块集群候选人振荡器组;和一个扩展的插入模块恢复基本周期为每个振荡器组。

作者:宁愣了

维护人员:宁愣了< lengning1 gmail.com >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.1”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“Oscope”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

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browseVignettes (“Oscope”)

PDF	R脚本	Oscope_vigette
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	GeneExpression,ImmunoOncology,RNASeq,测序,软件,StatisticalMethod
版本	1.24.0
Bioconductor自	BioC 3.2 (r - 3.2)(6.5年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	EBSeq,集群,testthat,BiocParallel
进口
链接
建议	BiocStyle
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	Oscope_1.24.0.tar.gz
Windows二进制	Oscope_1.24.0.zip
macOS 10.13(高山脉)	Oscope_1.24.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/Oscope
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ Oscope
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/Oscope/
包下载报告	下载数据