OmaDB

DOI:10.18129 / B9.bioc.OmaDB

此包适用于Bioconductor 3.14版;有关稳定的最新发布版本，请参见OmaDB．

OMA REST API的R包装器

Bioconductor版本:3.14

一个从OMA数据库下载骨科预测数据的软件包。

作者:Klara Kaleb

维护者:Klara Kaleb < Klara。ic.ac的Kaleb18。英国>，阿德里安·阿尔滕霍夫<阿德里安。Altenhoff在inf.ethz.ch>

安装

要安装此包，请启动R(版本“4.1”)并输入:

如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“OmaDB”)

超文本标记语言	R脚本	利用OmaDB探索分层正交组
超文本标记语言	R脚本	用OmaDB探索分类树
超文本标记语言	R脚本	开始使用OmaDB
超文本标记语言	R脚本	序列映射与OmaDB
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	注释，ComparativeGenomics，FunctionalGenomics，FunctionalPrediction，去，遗传学，软件
版本	2.10.0
在Bioconductor	BioC 3.7 (R-3.5)(4年)
许可证	GPL-3
取决于	R (>= 3.5)，httr(> = 1.2.1),plyr(> = 1.8.4)
进口	跑龙套,猿，Biostrings，GenomicRanges，IRanges、方法、topGO，jsonlite
链接
建议	knitr，rmarkdown，testthat
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/DessimozLab/OmaDB
BugReports	https://github.com/DessimozLab/OmaDB/issues
全靠我
进口我	PhyloProfile
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	OmaDB_2.10.0.tar.gz
Windows二进制	OmaDB_2.10.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra)	OmaDB_2.10.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/OmaDB
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/OmaDB
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/OmaDB/
软件包下载报告	下载数据