OmaDB

DOI:10.18129 / B9.bioc.OmaDB

此包适用于Bioconductor 3.14版;有关稳定的最新发布版本,请参见OmaDB

OMA REST API的R包装器

Bioconductor版本:3.14

一个从OMA数据库下载骨科预测数据的软件包。

作者:Klara Kaleb

维护者:Klara Kaleb < Klara。ic.ac的Kaleb18。英国>,阿德里安·阿尔滕霍夫<阿德里安。Altenhoff在inf.ethz.ch>

引文(从R内,输入引用(“OmaDB”)):

安装

要安装此包,请启动R(版本“4.1”)并输入:

如果(!require("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“OmaDB”)

超文本标记语言 R脚本 利用OmaDB探索分层正交组
超文本标记语言 R脚本 用OmaDB探索分类树
超文本标记语言 R脚本 开始使用OmaDB
超文本标记语言 R脚本 序列映射与OmaDB
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews 注释ComparativeGenomicsFunctionalGenomicsFunctionalPrediction遗传学软件
版本 2.10.0
在Bioconductor BioC 3.7 (R-3.5)(4年)
许可证 GPL-3
取决于 R (>= 3.5),httr(> = 1.2.1),plyr(> = 1.8.4)
进口 跑龙套,BiostringsGenomicRangesIRanges、方法、topGOjsonlite
链接
建议 knitrrmarkdowntestthat
SystemRequirements
增强了
URL https://github.com/DessimozLab/OmaDB
BugReports https://github.com/DessimozLab/OmaDB/issues
全靠我
进口我 PhyloProfile
建议我
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构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包 OmaDB_2.10.0.tar.gz
Windows二进制 OmaDB_2.10.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra) OmaDB_2.10.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/OmaDB
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:packages/OmaDB
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/OmaDB/
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  • 正常词 邮件列表——供包开发人员使用bob电竞体育官网