NeuCA

DOI:10.18129 / B9.bioc.NeuCA

此包适用于Bioconductor 3.14版;有关稳定的最新发布版本，请参见NeuCA．

基于神经网络的单细胞注释工具

Bioconductor版本:3.14

NeuCA是一种基于神经网络的scRNA-seq数据标注方法。它可以根据单元格类型的相关性自动调整分类策略，准确地标注单元格。NeuCA可以通过层次树自动利用单元类型的结构信息，提高标注精度。当数据包含密切相关的细胞类型时，它尤其有用。

作者:李子怡[aut]，冯昊[aut, cre]

维护:郝峰

安装

要安装此包，请启动R(版本“4.1”)并输入:

如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“NeuCA”)

超文本标记语言	R脚本	NeuCA包使用指南
PDF		参考手册

细节

biocViews	分类，DataImport，DataRepresentation，GeneExpression，NeuralNetwork，预处理，RNASeq，测序，SingleCell，软件，转录，转录组
版本	1.0.0
在Bioconductor	BioC 3.14 (R-4.1)(< 6个月)
许可证	GPL-2
取决于	R (>= 3.5.0)，keras，limma，e1071，SingleCellExperiment
进口
链接
建议	BiocStyle，knitr，rmarkdown，networkD3
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	NeuCA_1.0.0.tar.gz
Windows二进制
macOS 10.13 (High Sierra)	NeuCA_1.0.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/NeuCA
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/NeuCA
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/NeuCA/
软件包下载报告	下载数据