NanoStringNCTools

DOI:10.18129 / B9.bioc.NanoStringNCTools

这个包是3.14版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅NanoStringNCTools。

NanoString nCounter工具

Bioconductor版本:3.14

NanoString技术nCounter技术的工具。支持阅读RCC文件到一个ExpressionSet派生的对象。还包括质量控制方法和normalizaztion NanoString数据。

作者:帕特里克Aboyoun (aut),妮可Ortogero (cre)之杨(施)

维护人员:妮可Ortogero < nortogero nanostring.com >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.1”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“NanoStringNCTools”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“NanoStringNCTools”)

HTML	R脚本	介绍NanoStringRCCSet类
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文本		新闻
文本		许可证

细节

biocViews	CellBasedAssays,DataImport,GeneExpression,ProprietaryPlatforms,蛋白质组学,RNASeq,软件,转录,转录组,mRNAMicroarray
版本	1.2.0
Bioconductor自	BioC 3.13 (r - 4.1)(1年)
许可证	麻省理工学院
取决于	R (> = 3.6),Biobase,S4Vectors,ggplot2
进口	BiocGenerics,Biostrings,ggbeeswarm,ggiraph,ggthemesgrDevices,IRanges、方法、pheatmap,RColorBrewer统计,跑龙套
链接
建议	biovizBase,ggbio,RUnit,rmarkdown,knitr,qpdf
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我	GeomxTools,GeoMxWorkflows
进口我	GeoDiff
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	NanoStringNCTools_1.2.0.tar.gz
Windows二进制	NanoStringNCTools_1.2.0.zip
macOS 10.13(高山脉)	NanoStringNCTools_1.2.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/NanoStringNCTools
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ NanoStringNCTools
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/NanoStringNCTools/
包下载报告	下载数据