NBSplice

DOI:10.18129 / B9.bioc.NBSplice

此包适用于Bioconductor 3.14版;有关稳定的最新发布版本,请参见NBSplice

负二项式模型检测差分拼接

Bioconductor版本:3.14

该方案提出了一种基于异构体定量的差分拼接评价方法。它应用负二项分布的广义线性模型来推断异构体相对表达的变化。

作者:加布里埃拉·a·梅里诺和埃尔默·a·费尔南德斯

维护者:Gabriela Merino <美利奴。Gabriela33在gmail.com>

引文(从R内,输入引用(“NBSplice”)):

安装

要安装此包,请启动R(版本“4.1”)并输入:

如果(!require("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“NBSplice”)

超文本标记语言 R脚本 NBSplice-vignette
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews AlternativeSplicingDifferentialExpressionDifferentialSplicingImmunoOncologyRNASeq回归软件StatisticalMethod
版本 1.12.0
在Bioconductor BioC 3.8 (R-3.5)(3.5年)
许可证 GPL (> = 2)
取决于 R(>= 3.5),方法
进口 刨边机统计数据,质量mppaBiocParallelggplot2reshape2
链接
建议 knitrRUnitBiocGenericsBiocStylermarkdown减价
SystemRequirements
增强了
URL http://www.bdmg.com.ar
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包 NBSplice_1.12.0.tar.gz
Windows二进制 NBSplice_1.12.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra) NBSplice_1.12.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/NBSplice
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:packages/NBSplice
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/NBSplice/
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