MineICA

DOI:10.18129 / B9.bioc.MineICA

这个包是3.14版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅MineICA

分析ICA分解获得的基因组数据

Bioconductor版本:3.14

MineICA的目标是进行独立分量分析(ICA)在多个转录组数据集,将额外的数据(e。g分子、临床和病理)。这种综合ICA有助于组件通过研究它们的生物学解释与变量(e。g示例注释)和基因集,使组件的比较从不同的数据集使用correlation-based图。

作者:安妮Biton

维护人员:安妮Biton <安妮。在gmail.com biton >

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如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“MineICA”)

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PDF R脚本 MineICA:独立分量分析的基因组数据
PDF 参考手册

细节

biocViews MultipleComparison,软件,可视化
版本 1.34.0
Bioconductor自 BioC 2.12 (r - 3.0)(9年)
许可证 GPL-2
取决于 R(> = 2.10),方法,BiocGenerics(> = 0.13.8),Biobase,plyr,ggplot2,尺度,foreach,xtable,biomaRt,gtools,GOstats,集群,marray,mclust,RColorBrewer,色彩,igraph,Rgraphviz,,注释,Hmisc,fastICA,
进口 AnnotationDbi,光民,fpc,lumiHumanAll.db
链接
建议 biomaRt,GOstats,集群,hgu133a.db,mclust,igraph,breastCancerMAINZ,breastCancerTRANSBIG,breastCancerUPP,breastCancerVDX,未来,future.apply
SystemRequirements
增强了 doMC
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源包 MineICA_1.34.0.tar.gz
Windows二进制 MineICA_1.34.0.zip
macOS 10.13(高山脉) MineICA_1.34.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/MineICA
源库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/ MineICA
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/MineICA/
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