MicrobiotaProcess

DOI:10.18129 / B9.bioc.MicrobiotaProcess

此包适用于Bioconductor 3.14版;有关稳定的最新发布版本，请参见MicrobiotaProcess．

一个全面的R包，在整洁的框架内管理和分析微生物组和其他生态数据

Bioconductor版本:3.14

MicrobiotaProcess是一个用于微生物数据集分析、可视化和生物标志物发现的R包。它引入了MPSE类，这使得它与现有的计算生态系统更具互操作性。此外，还介绍了一种简洁的微生物组数据结构范式和分析语法。它在统一和通用的框架(整洁的框架)下提供了各种各样的微生物组分析程序。

作者:徐双斌[aut, cre]，于广创[aut, ctb]

维护人员:徐双斌< x双斌at 163.com>

安装

要安装此包，请启动R(版本“4.1”)并输入:

如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“MicrobiotaProcess”)

超文本标记语言	R脚本	微生物工艺简介
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	FeatureExtraction，微生物组，MultipleComparison，软件，可视化
版本	1.6.6
在Bioconductor	BioC 3.11 (R-4.0)(2年)
许可证	GPL (>= 3.0)
取决于	R (>= 4.0.0)
进口	猿，tidyr，ggplot2，magrittr，dplyr，Biostrings，ggrepel，素食主义者，动物园，ggtree，tidytree(> = 0.3.5),质量、方法、rlang，宠物猫， grDevices, stats, utils，硬币，ggsignif，拼接而成，ggstar，tidyselect，SummarizedExperiment，foreach，treeio(> = 1.17.2),支柱，dtplyr，ggtreeExtra
链接
建议	rmarkdown，prettydoc，testthat，knitr，nlme，phangorn，plyr，解读，randomForest，biomformat，尺度，yaml，withr，S4Vectors，purrr，seqmagick，胶水，corrr，ggupset，ggVennDiagram，gghalves，ggalluvial(> = 0.11.1),forcats，cli，phyloseq，aplot，ggnewscale，ggside，ggh4x，hopach
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/YuLab-SMU/MicrobiotaProcess/
BugReports	https://github.com/YuLab-SMU/MicrobiotaProcess/issues
全靠我
进口我
建议我
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构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	MicrobiotaProcess_1.6.6.tar.gz
Windows二进制	MicrobiotaProcess_1.6.6.zip
macOS 10.13 (High Sierra)	MicrobiotaProcess_1.6.6.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/MicrobiotaProcess
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/MicrobiotaProcess
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/MicrobiotaProcess/
软件包下载报告	下载数据