梅丽莎

DOI:10.18129 / B9.bioc.Melissa

这个包是3.14版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅梅丽莎。

贝叶斯聚类和单细胞methylomes imputationa

Bioconductor版本:3.14

梅丽莎是Baysian联合概率模型聚类并冠单细胞methylomes。这是通过考虑本地相关性通过广义线性模型方法和全球使用混合建模方法的相似之处。

作者:c . a . Kapourani (aut (cre)

维修工:c . a . Kapourani < kapouranis。安德烈亚斯在gmail.com >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.1”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“梅丽莎”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes(“梅丽莎”)

HTML	R脚本	1:过程和过滤scBS-seq数据
HTML	R脚本	2:集群使用梅丽莎和转嫁scBS-seq数据
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文本		新闻
文本		许可证

细节

biocViews	贝叶斯,聚类,报道,DNAMethylation,表观遗传学,FeatureExtraction,GeneExpression,GeneRegulation,遗传学,ImmunoOncology,KEGG,RNASeq,回归,测序,SingleCell,软件
版本	1.10.0
Bioconductor自	BioC 3.9 (r - 3.6)(3年)
许可证	GPL-3 |文件许可证
取决于	R (> = 3.5.0),BPRMeth,GenomicRanges
进口	data.table平行,ROCR,matrixcalc,mclust,ggplot2,doParallel,foreach,MCMCpack,cowplot,magrittr,mvtnorm,truncnorm,为了,BiocStyle统计,跑龙套
链接
建议	testthat,knitr,rmarkdown
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我
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构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	Melissa_1.10.0.tar.gz
Windows二进制	Melissa_1.10.0.zip
macOS 10.13(高山脉)	Melissa_1.10.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/Melissa
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/梅丽莎
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/Melissa/
包下载报告	下载数据