MatrixRider

DOI:10.18129 / B9.bioc.MatrixRider

这个包是3.14版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅MatrixRider。

获得总亲和力和入住率对给定矩阵结合位点序列

Bioconductor版本:3.14

计算一个数字整整一个序列,反映了DNA结合蛋白相互作用的倾向。DNA结合蛋白与烤瓷矩阵描述,例如从Jaspar得到。

作者:埃琳娜格拉希

维护人员:埃琳娜·葛拉<葛。在gmail.com e >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.1”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“MatrixRider”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“MatrixRider”)

PDF	R脚本	亲和力和入住率
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	GeneRegulation,遗传学,MotifAnnotation,软件
版本	1.26.0
Bioconductor自	BioC 3.1 (r - 3.2)(7年)
许可证	GPL-3
取决于	R (> = 3.1.2)
进口	方法,TFBSTools,IRanges,XVector,Biostrings
链接	IRanges,XVector,Biostrings,S4Vectors
建议	RUnit,BiocGenerics,BiocStyle,JASPAR2014
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	MatrixRider_1.26.0.tar.gz
Windows二进制	MatrixRider_1.26.0.zip
macOS 10.13(高山脉)	MatrixRider_1.26.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/MatrixRider
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ MatrixRider
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/MatrixRider/
包下载报告	下载数据