MSstatsTMTPTM

DOI:10.18129 / B9.bioc.MSstatsTMTPTM

这个包是弃用。它可能会从Bioconductor删除。请参考包临终的指导方针为更多的信息。

这个包是Bioconductor的3.14版本。这个包已经从Bioconductor删除。最后稳定,最新的发布版本,请参阅MSstatsTMTPTM。

后平移修改(天车)意义分析猎枪质量spectrometry-based蛋白质组的串联实验质量标签(TMT)标签

Bioconductor版本:3.14

后转译工具修改(天车)和蛋白质意义分析猎枪质量spectrometry-based蛋白质组学实验与串联质量标签(TMT)标签。功能后,这个包应该使用天车/蛋白质总结。他们可以用来总结的结果和模型总结了数据集的阴谋。

作者:德文郡科勒(aut (cre) Ting黄(aut) Mateusz Staniak (aut)之一Meena崔(aut) Tsung-Heng蔡(aut),奥尔加Vitek (aut)

维护人员:德文郡科勒<科勒。d: northeastern.edu >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.1”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“MSstatsTMTPTM”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

PDF		参考手册

细节

biocViews	DifferentialExpression,ImmunoOncology,MassSpectrometry,归一化,OneChannel,蛋白质组学,质量控制,软件,TwoChannel
版本	1.4.0
Bioconductor自	BioC 3.12 (r - 4.0)(1.5年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	R (> = 4.0)
进口	dplyr,gridExtra,stringr,reshape2,统计,跑龙套,ggplot2grDevices图形,MSstatsTMT,Rcpp
链接	Rcpp
建议	BiocStyle,knitr,rmarkdown,testthat,MSstats,covr
SystemRequirements
增强了
URL
BugReports	https://github.com/Vitek-Lab/MSstatsTMTPTM/issues
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包
Windows二进制
macOS 10.13(高山脉)
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/MSstatsTMTPTM
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ MSstatsTMTPTM
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/MSstatsTMTPTM/
包下载报告	下载数据