MPRAnalyze

DOI:10.18129 / B9.bioc.MPRAnalyze

这个包是3.14版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅MPRAnalyze。

MPRA数据的统计分析

Bioconductor版本:3.14

MPRAnalyze为数据分析提供统计框架生成的大规模并行记者化验(MPRAs),用来直接测量增强活动。MPRAnalyze可用于增强活动的量化,分类之间的活性增强剂和增强剂的比较分析活动的条件。嵌套MPRAnalyze构建一个对广义线性模型(glm)与DNA和RNA的观察,很容易可调各种实验设计和条件,提供了一组严格的统计testig方案。

作者:Tal Ashuach (aut (cre),大卫·费舍尔(aut),阿娜特Kriemer[所有],费边书J[所有],Nir Yosef(施)

维护人员:Tal Ashuach < tal_ashuach berkeley.edu >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.1”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“MPRAnalyze”)

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文档

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HTML	R脚本	分析与MPRAnalyze MPRA数据
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	CellBasedAssays,CellBiology,分类,DifferentialExpression,ExperimentalDesign,GeneExpression,ImmunoOncology,测序,软件,StatisticalMethod
版本	1.12.0
Bioconductor自	BioC 3.8 (r - 3.5)(3.5年)
许可证	GPL-3
取决于
进口	BiocParallel、方法、进步统计数据,SummarizedExperiment
链接
建议	knitr
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/YosefLab/MPRAnalyze
BugReports	https://github.com/YosefLab/MPRAnalyze
取决于我
进口我
建议我
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构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	MPRAnalyze_1.12.0.tar.gz
Windows二进制	MPRAnalyze_1.12.0.zip
macOS 10.13(高山脉)	MPRAnalyze_1.12.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/MPRAnalyze
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ MPRAnalyze
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/MPRAnalyze/
包下载报告	下载数据