米拉
DOI:10.18129 / B9.bioc.MIRA
这个包是3.14版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅米拉。
Methylation-Based推理的监管活动
Bioconductor版本:3.14
DNA甲基化包含的信息监管状态的细胞。米拉公司聚集成DNA甲基化DNA甲基化数据概要文件对于一个给定的地区设置共享生物注释。使用此配置文件,米拉推断和成绩的集体管理活动对该地区集。米拉促进监管分析古典监管的情况下分析将会困难,而且还要允许将公共资源地区集用于小说了解DNA甲基化数据集的管理状态。
作者:内森·谢菲尔德< http://www.databio.org > (aut) Christoph烈性黑啤酒(施),约翰·劳森(aut (cre)
维护人员:约翰·劳森< jtl2hk virginia.edu >
从内部引用(R,回车引用(“米拉”)):
安装
安装这个包,开始R(版本“4.1”)并输入:
如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“米拉”)
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文档
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browseVignettes(“米拉”)
| HTML | R脚本 | 米拉应用到一个生物问题 |
| HTML | R脚本 | 开始使用Methylation-based推理的监管活动 |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 |
细节
| biocViews | ChIPSeq,报道,DNAMethylation,表观遗传学,FunctionalGenomics,GeneRegulation,GenomeAnnotation,ImmunoOncology,MethylSeq,测序,软件,SystemsBiology |
| 版本 | 1.16.0 |
| Bioconductor自 | BioC 3.6 (r - 3.4)(4.5年) |
| 许可证 | GPL-3 |
| 取决于 | R (> = 3.5) |
| 进口 | BiocGenerics,S4Vectors,IRanges,GenomicRanges,data.table,ggplot2,Biobase统计数据,bsseq、方法 |
| 链接 | |
| 建议 | knitr平行,testthat,BiocStyle,rmarkdown,AnnotationHub,萝拉 |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | http://databio.org/mira |
| BugReports | https://github.com/databio/MIRA |
| 取决于我 | |
| 进口我 | 可可 |
| 建议我 | |
| 我的链接 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
| 源包 | MIRA_1.16.0.tar.gz |
| Windows二进制 | MIRA_1.16.0.zip |
| macOS 10.13(高山脉) | MIRA_1.16.0.tgz |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/MIRA |
| 源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/米拉 |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/MIRA/ |
| 包下载报告 | 下载数据 |
