米拉

DOI:10.18129 / B9.bioc.MIRA

这个包是3.14版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅米拉

Methylation-Based推理的监管活动

Bioconductor版本:3.14

DNA甲基化包含的信息监管状态的细胞。米拉公司聚集成DNA甲基化DNA甲基化数据概要文件对于一个给定的地区设置共享生物注释。使用此配置文件,米拉推断和成绩的集体管理活动对该地区集。米拉促进监管分析古典监管的情况下分析将会困难,而且还要允许将公共资源地区集用于小说了解DNA甲基化数据集的管理状态。

作者:内森·谢菲尔德< http://www.databio.org > (aut) Christoph烈性黑啤酒(施),约翰·劳森(aut (cre)

维护人员:约翰·劳森< jtl2hk virginia.edu >

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安装

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HTML R脚本 开始使用Methylation-based推理的监管活动
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文本 新闻

细节

biocViews ChIPSeq,报道,DNAMethylation,表观遗传学,FunctionalGenomics,GeneRegulation,GenomeAnnotation,ImmunoOncology,MethylSeq,测序,软件,SystemsBiology
版本 1.16.0
Bioconductor自 BioC 3.6 (r - 3.4)(4.5年)
许可证 GPL-3
取决于 R (> = 3.5)
进口 BiocGenerics,S4Vectors,IRanges,GenomicRanges,data.table,ggplot2,Biobase统计数据,bsseq、方法
链接
建议 knitr平行,testthat,BiocStyle,rmarkdown,AnnotationHub,萝拉
SystemRequirements
增强了
URL http://databio.org/mira
BugReports https://github.com/databio/MIRA
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源包 MIRA_1.16.0.tar.gz
Windows二进制 MIRA_1.16.0.zip
macOS 10.13(高山脉) MIRA_1.16.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/MIRA
源库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/米拉
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/MIRA/
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