KEGGprofile

DOI:10.18129 / B9.bioc.KEGGprofile

这个包是弃用。它可能会从Bioconductor删除。请参考包临终的指导方针为更多的信息。

这个包是Bioconductor的3.14版本。这个包已经从Bioconductor删除。最后稳定,最新的发布版本,请参阅KEGGprofile。

一个注释和可视化包多类型和KEGG说明表达数据通路

Bioconductor版本:3.14

KEGGprofile是一个注释和可视化工具集成表达谱和KEGG通路的功能注释的地图。多类型,说明在一个路径表达式可以可视化数据地图。KEGGprofile促进更多关于特定功能的详细分析内部通路或时间变化相关性在不同的基因和样本。

作者:石林赵、燕郭于Shyr

维护人员:石林赵<石林。赵:vanderbilt.edu >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.1”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“KEGGprofile”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

PDF		参考手册

细节

biocViews	KEGG,通路,软件
版本	1.36.0
Bioconductor自	BioC 2.11 (r - 2.15)(9.5年)
许可证	GPL (> = 2)
取决于
进口	AnnotationDbi,png,TeachingDemos,XMLKEGG.db,KEGGREST,biomaRt,RCurl,ggplot2,reshape2
链接
建议
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构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包
Windows二进制
macOS 10.13(高山脉)
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/KEGGprofile
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ KEGGprofile
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/KEGGprofile/
包下载报告	下载数据