ImmuneSpaceR

DOI:10.18129 / B9.bioc.ImmuneSpaceR

这个包是3.14版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅ImmuneSpaceR

一个瘦包装器ImmuneSpace数据库

Bioconductor版本:3.14

提供了一个方便的API,用于访问数据集内ImmuneSpace (www.immunespace.org),数据仓库和分析平台的人类免疫学项目财团(债)。

作者:格雷格Finak (aut),升井Sauteraud (aut),迈克江(aut),吉尔Guday (aut),狮子座Dashevskiy (aut),埃文·亨利克先生(aut),居Yeong金(aut),劳伦·沃尔夫(aut),海伦·米勒(aut),拉斐尔Gottardo (aut) ImmuneSpace包维护者(cre (cph)

维修工:ImmuneSpace包维护者< ImmuneSpace gmail.com >

从内部引用(R,回车引用(“ImmuneSpaceR”)):

安装

安装这个包,开始R(版本“4.1”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“ImmuneSpaceR”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“ImmuneSpaceR”)

HTML R脚本 介绍ImmuneSpaceR包
HTML R脚本 下载数据集与getDataset
HTML R脚本 处理与ImmuneSpaceR矩阵表达式
HTML R脚本 interactive_netrc()函数介绍
HTML R脚本 Neutralizition SDY144:相关的海/病毒效价和细胞数量
HTML R脚本 SDY180:丰富的Plasmablasts衡量多参数流式细胞术
HTML R脚本 SDY269:关联有关酶联免疫斑点的结果。海和流式细胞术
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews DataImport,DataRepresentation,软件,ThirdPartyClient
版本 1.22.0
Bioconductor自 BioC 3.3 (r - 3.3)(6年)
许可证 GPL-2
取决于 R (> = 3.5.0)
进口 跑龙套,R6,data.table,旋度,httr,Rlabkey(> = 2.3.1),Biobase,pheatmap,ggplot2(> = 3.2.0),尺度统计数据,gplots,情节,的热图(> = 0.7.0),jsonlite,rmarkdown,preprocessCore,flowCore,flowWorkspace,消化
链接
建议 knitr,testthat
SystemRequirements
增强了
URL https://github.com/RGLab/ImmuneSpaceR
BugReports https://github.com/RGLab/ImmuneSpaceR/issues
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包 ImmuneSpaceR_1.22.0.tar.gz
Windows二进制 ImmuneSpaceR_1.22.0.zip
macOS 10.13(高山脉) ImmuneSpaceR_1.22.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/ImmuneSpaceR
源库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/ ImmuneSpaceR
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/ImmuneSpaceR/
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  • 支持网站——关于Bioconductor包的问题
  • 正常词 开发人员邮件列表,包bob电竞体育官网