IgGeneUsage

DOI:10.18129 / B9.bioc.IgGeneUsage

这个包是3.14版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅IgGeneUsage。

微分在免疫基因的使用体验

Bioconductor版本:3.14

偏差检测的免疫球蛋白(Ig)基因适应性免疫之间的使用体验,属于不同的生物在免疫曲目分析条件是一个重要的任务。IgGeneUsage检测异常搞笑基因使用使用概率模型分析计算的贝叶斯推理。

作者:单Kitanovski (aut (cre)

维护人员:单Kitanovski <极点。在uni-due.de kitanovski >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.1”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“IgGeneUsage”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

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browseVignettes (“IgGeneUsage”)

HTML	R脚本	用户手册:IgGeneUsage
PDF		参考手册
文本		新闻
文本		许可证

细节

biocViews	贝叶斯,DifferentialExpression,遗传学,回归,软件
版本	1.8.0
Bioconductor自	BioC 3.10 (r - 3.6)(2.5年)
许可证	文件许可证
取决于	方法、R (> = 3.6.0)Rcpp(> = 0.12.0),SummarizedExperiment,StanHeaders(> 2.18.1)
进口	rstan(> = 2.19.2),reshape2(> = 3)
链接
建议	BiocStyle,knitr,rmarkdown,testthat(> =魅惑,ggplot2,ggforce,gridExtra,ggrepel
SystemRequirements
增强了
URL
BugReports	https://github.com/snaketron/IgGeneUsage/issues
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	IgGeneUsage_1.8.0.tar.gz
Windows二进制
macOS 10.13(高山脉)	IgGeneUsage_1.8.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/IgGeneUsage
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ IgGeneUsage
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/IgGeneUsage/
包下载报告	下载数据