哈曼
DOI:10.18129 / B9.bioc.Harman
此包适用于Bioconductor 3.14版;有关稳定的最新发布版本，请参见哈曼．
使用PCA和基于约束优化的技术从数据集中去除批处理效应
Bioconductor版本:3.14
Harman是一种基于PCA和约束优化的技术，它最大限度地从数据集中去除批量效应，并限制过度校正的概率(即去除真正的生物信号和批量噪声)保持在由最终用户设置的分数范围内。
作者:Josh Bowden [aut]， Jason Ross [aut, cre]， Yalchin Oytam [aut]
维护者:Jason Ross < Jason。罗斯在csiro.au>
引文(从R内，输入引用(“哈曼”))：
安装
要安装此包，请启动R(版本“4.1”)并输入:
如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")
对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．
文档
要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:
哈曼browseVignettes(“”)
| 超文本标记语言 | R脚本 | IntroductionToHarman |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 |
细节
| biocViews | BatchEffect，DNAMethylation，微阵列，MultipleComparison，归一化，预处理，PrincipalComponent，软件，StatisticalMethod，转录 |
| 版本 | 1.22.0 |
| 在Bioconductor | BioC 3.3 (R-3.3)(6年) |
| 许可证 | GPL-3 +文件许可证 |
| 取决于 | R (>= 3.6) |
| 进口 | Rcpp(>= 0.11.2)，图形，统计，方法 |
| 链接 | Rcpp |
| 建议 | HarmanData，BiocGenerics，BiocStyle，knitr，rmarkdown，RUnit，RColorBrewer，bladderbatch，limma，minfi，光民，msmsEDA，affydata，minfiData，股东价值分析 |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | http://www.bioinformatics.csiro.au/harman/ |
| BugReports | https://github.com/JasonR055/Harman/issues |
| 全靠我 | |
| 进口我 | debrowser |
| 建议我 | |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
| 源包 | Harman_1.22.0.tar.gz |
| Windows二进制 | Harman_1.22.0.zip(32位和64位) |
| macOS 10.13 (High Sierra) | Harman_1.22.0.tgz |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/Harman |
| 源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:packages/Harman |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/Harman/ |
| 软件包下载报告 | 下载数据 |
