GenVisR

DOI:10.18129 / B9.bioc.GenVisR

这个包是3.14版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅GenVisR

在R基因可视化

Bioconductor版本:3.14

主要生产高度可定制的出版质量基因组数据的图形在队列级别。

作者:圣扎迦利斯基德莫尔(aut (cre),亚历克斯·瓦格纳(aut)罗伯特·Lesurf (aut),凯蒂·坎贝尔(aut),杰森Kunisaki (aut), Obi格里菲斯(aut),玛拉基书格里菲斯(aut)

维护人员:扎卡里·斯基德莫尔< zlskidmore gmail.com >

从内部引用(R,回车引用(“GenVisR”)):

安装

安装这个包,开始R(版本“4.1”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“GenVisR”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“GenVisR”)

HTML R脚本 GenVisR:介绍
HTML R脚本 可视化小变异
HTML R脚本 瀑布:功能介绍
PDF 参考手册
文本 新闻
文本 许可证

细节

biocViews 分类,DNASeq,DataRepresentation,基础设施,软件
版本 1.26.0
Bioconductor自 BioC 3.3 (r - 3.3)(6年)
许可证 GPL-3 +文件许可证
取决于 R(> = 3.3.0)方法
进口 AnnotationDbi,biomaRt(> = 2.45.8),BiocGenerics,Biostrings,DBI,FField,GenomicFeatures,GenomicRanges(> = 1.25.4),ggplot2(> =魅惑,gridExtra(> = 2.0.0),gtable,gtools,IRanges(> = 2.7.5),plyr(> = 1.8.3),reshape2,Rsamtools,尺度,冬青,data.table,BSgenome,GenomeInfoDb,VariantAnnotation
链接
建议 BiocStyle,BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg19,knitr,RMySQL,roxygen2,testthat,TxDb.Hsapiens.UCSC.hg19.knownGene,rmarkdown,vdiffr,formatR,TxDb.Hsapiens.UCSC.hg38.knownGene,BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg38
SystemRequirements
增强了
URL
BugReports https://github.com/griffithlab/GenVisR/issues
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包 GenVisR_1.26.0.tar.gz
Windows二进制 GenVisR_1.26.0.zip
macOS 10.13(高山脉) GenVisR_1.26.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/GenVisR
源库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/ GenVisR
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/GenVisR/
包下载报告 下载数据

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  • 支持网站——关于Bioconductor包的问题
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