GSRI

DOI:10.18129 / B9.bioc.GSRI

这个包是3.14版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅GSRI。

基因设置调节指数

Bioconductor版本:3.14

GSRI包估计的数量差异表达基因在基因集,利用基因设置调节指数的概念(GSRI)。

作者:朱利安格林Kilian Bartholome克莱门斯克鲁兹,Jens蒂莫

维护人员:朱利安格林< jg-bioc gmx.com >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.1”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“GSRI”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“GSRI”)

PDF	R脚本	介绍GSRI包:利用基因设置调节指数评估监管效果
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	DifferentialExpression,GeneRegulation,GeneSetEnrichment,微阵列,软件,转录
版本	2.42.0
Bioconductor自	BioC 2.6 (r - 2.11)(12年)
许可证	GPL-3
取决于	R (> = 2.14.2),fdrtool
进口	方法、图形数据,跑龙套,genefilter,Biobase,GSEABase,莱斯(> = 1.1.6)
链接
建议	limma,hgu95av2.db
SystemRequirements
增强了	平行
URL
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	GSRI_2.42.0.tar.gz
Windows二进制	GSRI_2.42.0.zip(32位和64位)
macOS 10.13(高山脉)	GSRI_2.42.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/GSRI
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ GSRI
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/GSRI/
包下载报告	下载数据