GSAR

DOI:10.18129 / B9.bioc.GSAR

这个包是3.14版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅GSAR。

分析R基因集

Bioconductor版本:3.14

使用特定基因集合分析替代假说。测试微分表达式,规模和净相关结构。

作者:亚希尔Rahmatallah < yrahmatallah uams.edu >,加林娜Glazko < gvglazko uams.edu >

维护人员:亚希尔Rahmatallah < yrahmatallah uams.edu >,加林娜Glazko < gvglazko uams.edu >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.1”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“GSAR”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“GSAR”)

PDF	R脚本	基因集合分析R——GSAR包
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	DifferentialExpression,软件,StatisticalMethod
版本	1.28.0
Bioconductor自	BioC 3.0 (r - 3.1)(7.5年)
许可证	GPL (> = 2)
取决于	R (> = 3.0.1),igraph(> =是0.7.1)
进口	统计数据、图形
链接
建议	质量,GSVAdata,所有,tweeDEseqCountData,GSEABase,注释,org.Hs.eg.db,Biobase,genefilter,hgu95av2.db,刨边机,BiocStyle
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	GSAR_1.28.0.tar.gz
Windows二进制	GSAR_1.28.0.zip
macOS 10.13(高山脉)	GSAR_1.28.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/GSAR
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ GSAR
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/GSAR/
包下载报告	下载数据