GOSim

DOI:10.18129 / B9.bioc.GOSim

这个包是3.14版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅GOSim。

计算功能相似的条款和基因产物;去富集分析

Bioconductor版本:3.14

这个方案实现了几个函数用于计算相似性和基因产品基于他们的注释。而且它允许计算富集分析

作者:Holger Froehlich < frohlich在bit.uni-bonn.de >

维修工:Holger Froehlich < frohlich在bit.uni-bonn.de >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.1”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“GOSim”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“GOSim”)

PDF	R脚本	GOsim
PDF		参考手册

细节

biocViews	聚类,去,通路,软件
版本	1.32.0
Bioconductor自	BioC 2.13 (r - 3.0)(8.5年)
许可证	GPL (> = 2)
取决于	GO.db,注释
进口	org.Hs.eg.db,AnnotationDbi,topGO,集群,flexmix,RBGL,图,矩阵,corpcor,Rcpp
链接	Rcpp
建议
SystemRequirements
增强了	igraph
URL
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	GOSim_1.32.0.tar.gz
Windows二进制	GOSim_1.32.0.zip
macOS 10.13(高山脉)	GOSim_1.32.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/GOSim
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ GOSim
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/GOSim/
包下载报告	下载数据