FGNet

DOI:10.18129 / B9.bioc.FGNet

这个包是3.14版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅FGNet。

功能基因网络来源于生物富集分析

Bioconductor版本:3.14

构建和可视化功能基因和浓缩的聚类分析在多个注释术语网络空间。包包括一个图形用户界面(GUI)和功能进行功能富集分析通过大卫,GeneTerm链接器,计(GSEA)和topGO。

作者:Sara Aibar,西莉亚Fontanillo,康拉德Droste和哈维尔·De Las里瓦斯。

维护人员:莎拉Aibar < saibar在usal.es >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.1”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“FGNet”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“FGNet”)

HTML	R脚本	FGNet
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	注释,聚类,FunctionalGenomics,去,GeneSetEnrichment,网络,NetworkEnrichment,通路,软件,可视化
版本	3.28.0
Bioconductor自	BioC 2.13 (r - 3.0)(8.5年)
许可证	GPL (> = 2)
取决于	R (> = 2.15)
进口	igraph(> = 0.6),hwriter,R.utils,XML,plotrix,reshape2,RColorBrewer,png、方法、数据、图形、grDevices跑龙套
链接
建议	RCurl,计,topGO,GO.db,reactome.db,RUnit,BiocGenerics,org.Sc.sgd.db,knitr,rmarkdown,AnnotationDbiRGtk2,BiocManager
SystemRequirements
增强了
URL	http://www.cicancer.org
取决于我
进口我	IntramiRExploreR
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	FGNet_3.28.0.tar.gz
Windows二进制	FGNet_3.28.0.zip
macOS 10.13(高山脉)	FGNet_3.28.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/FGNet
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ FGNet
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/FGNet/
包下载报告	下载数据