ExperimentSubset

DOI:10.18129 / B9.bioc.ExperimentSubset

这个包是3.14版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅ExperimentSubset

管理与Bioconductor实验对象的数据子集

Bioconductor版本:3.14

实验对象如SummarizedExperiment或SingleCellExperiment为一个或多个矩阵像化验数据容器及其相关的行和列的数据。通常只有一个子集的原始数据需要加分析。例如,过滤质量差样品前需要排除一些列分析。ExperimentSubset对象是一个容器来有效地管理不同子集的相同的数据,而不必为每个新子集使单独的对象。

作者:Irzam Sarfraz (aut (cre)黑色,穆罕默德阿西夫(aut)约书亚·d·坎贝尔(aut)

维护人员:Irzam Sarfraz < irzam9095 gmail.com >

从内部引用(R,回车引用(“ExperimentSubset”)):

安装

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如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“ExperimentSubset”)

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文档

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文本 新闻
文本 许可证

细节

biocViews DataImport,DataRepresentation,基础设施,软件
版本 1.4.0
Bioconductor自 BioC 3.12 (r - 4.0)(1.5年)
许可证 麻省理工学院+文件许可证
取决于 R (> = 4.0.0),SummarizedExperiment,SingleCellExperiment,SpatialExperiment,TreeSummarizedExperiment
进口 方法,矩阵,S4Vectors
链接
建议 BiocStyle,knitr,rmarkdown,testthat,covr统计数据,食物,,scds,TENxPBMCData,气道
SystemRequirements
增强了
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取决于我
进口我
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包档案

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源包 ExperimentSubset_1.4.0.tar.gz
Windows二进制 ExperimentSubset_1.4.0.zip
macOS 10.13(高山脉) ExperimentSubset_1.4.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/ExperimentSubset
源库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/ ExperimentSubset
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/ExperimentSubset/
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