EnMCB

DOI:10.18129 / B9.bioc.EnMCB

这个包是3.14版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅EnMCB。

基于甲基化预测疾病进展相关的块使用整体模型

Bioconductor版本:3.14

创建使用DNA甲基化概要文件相关的块。堆叠的机器学习模型,结合《考克斯,支持向量机和elastic-net回归模型,可以构造预测疾病进展。

作者:鑫玉

维护人员:Xin Yu < whirlsyu gmail.com >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.1”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“EnMCB”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

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细节

biocViews	DNAMethylation,MethylationArray,归一化,软件,SupportVectorMachine
版本	1.6.0
Bioconductor自	BioC 3.11 (r - 4.0)(2年)
许可证	GPL-2
取决于	R (> = 4.0)
进口	foreach,doParallel、并行数据,survivalROC,glmnet,rms,mboost,survivalsvm,ggplot2,IlluminaHumanMethylation450kanno.ilmn12.hg19,minfi,引导,生存,跑龙套
链接
建议	SummarizedExperiment,testthat,Biobase,survminer,affycoretools,knitr,plotROC,prognosticROC,rmarkdown
SystemRequirements
增强了
URL
BugReports	https://github.com/whirlsyu/EnMCB/issues
取决于我
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包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	EnMCB_1.6.0.tar.gz
Windows二进制	EnMCB_1.6.0.zip
macOS 10.13(高山脉)	EnMCB_1.6.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/EnMCB
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ EnMCB
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/EnMCB/
包下载报告	下载数据