这个包是Bioconductor的3.14版本。这个包已经从Bioconductor删除。最后稳定,最新的发布版本,请参阅EWCE。
Bioconductor版本:3.14
用来确定哪些类型的细胞内丰富基因列表。包提供了工具测试充实在简单的基因列表(如人类疾病相关基因)和微分表达式产生的那些研究。包不依赖于任何特定的单细胞转录组数据集和用户定义的数据集可以加载和使用的分析。
维修工:艾伦·墨菲在hotmail.com < alanmurph94 >
从内部引用(R,回车引用(“EWCE”)
):
安装这个包,开始R(版本“4.1”)并输入:
如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“EWCE”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (“EWCE”)
HTML | R脚本 | 表达加权与EWCE Celltype浓缩 |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | BiomedicalInformatics,DifferentialExpression,FunctionalGenomics,GeneExpression,GeneSetEnrichment,遗传学,微阵列,OneChannel,蛋白质组学,RNASeq,SingleCell,软件,转录,可视化,mRNAMicroarray |
版本 | 1.2.0 |
Bioconductor自 | BioC 3.3 (r - 3.3)(6年) |
许可证 | 艺术- 2.0 |
取决于 | R (> = 4.1),RNOmni(> = 1.0) |
进口 | AnnotationHub,ewceData,ExperimentHub,ggplot2、grDevices、网格reshape2,biomaRt,limma,stringr,cowplot,HGNChelper,ggdendro,gridExtra,矩阵、方法、并行未来,尺度,SummarizedExperiment统计,跑龙套 |
链接 | |
建议 | devtools,knitr,BiocStyle,rmarkdown,testthat(> = 3.0.0),data.table,sctransform,readxl,SingleCellExperiment,memoise,减价 |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | https://github.com/NathanSkene/EWCE |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
我的链接 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
源包 | EWCE_1.2.0.tar.gz |
Windows二进制 | EWCE_1.2.0.zip(32位和64位) |
macOS 10.13(高山脉) | EWCE_1.2.0.tgz |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/EWCE |
源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/ EWCE |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/EWCE/ |
包下载报告 | 下载数据 |