ComplexHeatmap

DOI:10.18129 / B9.bioc.ComplexHeatmap

这个包是3.14版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅ComplexHeatmap。

使复杂的热图

Bioconductor版本:3.14

复杂的热图是有效的可视化不同来源的数据集之间的联系,揭示潜在的模式。这里ComplexHeatmap包提供了一个高度灵活的方式安排多个热图和支持各种注释图形。

作者:Zuguang顾

维护人员:Zuguang顾< z。顾在dkfz.de >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.1”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“ComplexHeatmap”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“ComplexHeatmap”)

HTML		complex_heatmap.html
HTML	R脚本	最可能问的问题
PDF		参考手册
文本		新闻
文本		许可证

细节

biocViews	测序,软件,可视化
版本	2.10.0
Bioconductor自	BioC 3.1 (r - 3.2)(7年)
许可证	麻省理工学院+文件许可证
取决于	R(> = 3.5.0)、方法、网格,图形,统计,grDevices
进口	circlize(> = 0.4.5),GetoptLong,色彩,线索,RColorBrewer,GlobalOptions(> = 0.1.0),png,消化,IRanges,matrixStats,foreach,doParallel
链接
建议	testthat(> = 1.0.0),knitr,减价,dendsort,jpeg,tiff,fastcluster,EnrichedHeatmap,dendextend(> = 1.0.1),grImport,grImport2,胶水,GenomicRanges,gridtext,pheatmap(> = 1.0.12),gridGraphics,gplots,rmarkdown,开罗
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/jokergoo/ComplexHeatmaphttps://jokergoo.github.io/ComplexHeatmap-reference/book/
取决于我	意大利苦杏酒,EnrichedHeatmap,收回
进口我	airpart,BiocOncoTK,BioNERO,blacksheepr,BloodGen3Module,催化剂,celda,CeTF,可可,可乐,cytoKernel,DEComplexDisease,DEGreport,部,diffcyt,diffUTR,埃尔默,fCCAC,gCrisprTools,GeneTonic,GenomicSuperSignature,gmoviz,InteractiveComplexHeatmap,InterCellar,iSEE,LineagePulse,MatrixQCvis,MesKit,microbiomeMarker,现代艺术博物馆,蒙娜丽莎,马斯喀特,musicatk,MWASTools,PathoStat,PeacoQC,pipeComp,POMA,profileplyr,RLSeq,sechm,裂殖体,SEtools,simplifyEnrichment,singleCellTK,麻雀,TBSignatureProfiler,TCGAWorkflow,Xeva,YAPSA
建议我	阿尔卑斯山脉,artMS,bambu,BindingSiteFinder,BrainSABER,clustifyr,CNVRanger,dittoSeq,EnrichmentBrowser,gtrellis,HilbertCurve,msImpute,NanoporeRNASeq,plotgardener,projectR,QFeatures,scDblFinder,的,TCGAbiolinks,TCGAutils,TimeSeriesExperiment,weitrix
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	ComplexHeatmap_2.10.0.tar.gz
Windows二进制	ComplexHeatmap_2.10.0.zip
macOS 10.13(高山脉)	ComplexHeatmap_2.10.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/ComplexHeatmap
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ ComplexHeatmap
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/ComplexHeatmap/
包下载报告	下载数据