我思
DOI:10.18129 / B9.bioc.Cogito
此包适用于Bioconductor 3.14版;有关稳定的最新发布版本，请参见我思．
比较基因组间隔工具-关于基因组和表观基因组数据集的自动化，完整，可重复和清晰的报告
Bioconductor版本:3.14
生物学研究通常包括多种条件，这些条件通过不同的实验室设置进行检查，如rna测序或芯片测序。为了获得整个结果数据集的概述，Cogito提供了一个关于所有样本和所有不同样本之间的基本比较的自动化、完整、可重复和清晰的报告。该报告可以用作关于数据集的文档，也可以用作进一步自定义分析的起点。
作者:安妮卡Bürger [cre, aut]
维护者:Annika Bürger
引文(从R内，输入引用(“我思”))：
安装
要安装此包，请启动R(版本“4.1”)并输入:
如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")
对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．
文档
要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:
browseVignettes(“我思”)
| 超文本标记语言 | R脚本 | Cogito:比较注释的基因组间隔工具 |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 |
细节
| biocViews | FunctionalGenomics，GeneRegulation，测序，软件 |
| 版本 | 1.0.0 |
| 在Bioconductor | BioC 3.14 (R-4.1)(< 6个月) |
| 许可证 | LGPL-3 |
| 取决于 | R (>= 4.1)，GenomicRanges，jsonlite，GenomicFeatures，熵 |
| 进口 | BiocManager，rmarkdown，GenomeInfoDb，S4Vectors，AnnotationDbi，图形，统计，utils，方法，magrittr，ggplot2，TxDb.Mmusculus.UCSC.mm9.knownGene |
| 链接 | |
| 建议 | BiocStyle，knitr，减价，testthat(> = 3.0.0) |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | |
| 全靠我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
| 源包 | Cogito_1.0.0.tar.gz |
| Windows二进制 | Cogito_1.0.0.zip |
| macOS 10.13 (High Sierra) | Cogito_1.0.0.tgz |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/Cogito |
| 源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:packages/Cogito |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/Cogito/ |
| 软件包下载报告 | 下载数据 |
