ChromHeatMap

DOI:10.18129 / B9.bioc.ChromHeatMap

这个包是3.14版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅ChromHeatMap。

热量由基因组地图绘制坐标

Bioconductor版本:3.14

ChromHeatMap包可以用来情节全基因组数据(如表情、全息、SNP)给定的每一链染色体热图。生成的热量地图可用于交互识别探测器和感兴趣的基因。

作者:蒂姆·f·雷纳

维护人员:蒂姆·f·雷纳< tfrayner gmail.com >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.1”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“ChromHeatMap”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“ChromHeatMap”)

PDF	R脚本	策划与ChromHeatMap表达数据
PDF		参考手册

细节

biocViews	软件,可视化
版本	1.48.0
Bioconductor自	BioC 2.5 (r - 2.10)(12.5年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	R (> = 2.9.0),BiocGenerics(> = 0.3.2),注释(> = 1.20.0),AnnotationDbi(> = 1.4.0)
进口	Biobase(> = 2.17.8)、图形grDevices,方法,属性,IRanges,rtracklayer,GenomicRanges
链接
建议	所有,hgu95av2.db
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	ChromHeatMap_1.48.0.tar.gz
Windows二进制	ChromHeatMap_1.48.0.zip
macOS 10.13(高山脉)	ChromHeatMap_1.48.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/ChromHeatMap
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ ChromHeatMap
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/ChromHeatMap/
包下载报告	下载数据