芝加哥

DOI:10.18129 / B9.bioc.Chicago

这个包是3.14版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅芝加哥

芝加哥:捕捉高c基因组组织的分析

Bioconductor版本:3.14

分析获取高c数据的管道。

作者:乔纳森·凯恩斯Paula Freire普里切特,史蒂文Wingett,米哈伊尔•Spivakov

维修工:米哈伊尔Spivakov <米哈伊尔。在lms.mrc.ac.uk spivakov >

从内部引用(R,回车引用(“芝加哥”)):

安装

安装这个包,开始R(版本“4.1”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(《芝加哥》)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes(“芝加哥”)

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文本 新闻

细节

biocViews 表观遗传学,,测序,软件
版本 1.22.0
Bioconductor自 BioC 3.3 (r - 3.3)(6年)
许可证 艺术- 2.0
取决于 R (> = 3.3.1),data.table
进口 matrixStats,质量,Hmisc,Delaporte、方法、grDevices图形、统计、跑龙套
链接
建议 argparse,BiocStyle,knitr,rmarkdown,PCHiCdata,testthat,Rsamtools,GenomicInteractions,GenomicRanges,IRanges,AnnotationHub
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我 PCHiCdata
进口我
建议我
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构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包 Chicago_1.22.0.tar.gz
Windows二进制 Chicago_1.22.0.zip
macOS 10.13(高山脉) Chicago_1.22.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/Chicago
源库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/芝加哥
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/Chicago/
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