ChIPsim

DOI:10.18129 / B9.bioc.ChIPsim

这个包是3.14版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅ChIPsim。

模拟ChIP-seq实验

Bioconductor版本:3.14

一个通用的框架,ChIP-seq数据的仿真。虽然目前集中在核小体定位包的目的是支持不同类型的实验。

作者:彼得·汉保格

维护人员:彼得汉保格<彼得。汉保格gmail.com >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.1”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“ChIPsim”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“ChIPsim”)

PDF	R脚本	模拟ChIP-seq实验
PDF		参考手册

细节

biocViews	ChIPSeq,基础设施,软件
版本	1.48.0
Bioconductor自	BioC 2.5 (r - 2.10)(12.5年)
许可证	GPL (> = 2)
取决于	Biostrings(> = 2.29.2)
进口	IRanges,XVector,Biostrings,ShortRead、图形方法,统计,跑龙套
链接
建议	actuar,动物园
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	ChIPsim_1.48.0.tar.gz
Windows二进制	ChIPsim_1.48.0.zip
macOS 10.13(高山脉)	ChIPsim_1.48.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/ChIPsim
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ ChIPsim
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/ChIPsim/
包下载报告	下载数据