别致的

DOI:10.18129 / B9.bioc.ChIC

这个包是3.14版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅别致的。

质量控制管道ChIP-Seq数据

Bioconductor版本:3.14

质量控制(QC)管道ChIP-seq数据使用一组全面的质量控制指标,包括此前提出的指标以及小说的,基于局部特征的浓缩。包提供函数来计算一组质量控制指标,与参考价值和机器学习纲要样品质量评价模型。

作者:卡门·玛丽亚Livi

维护人员:卡门·玛丽亚Livi <卡门。在external.ifom.eu livi >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.1”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“别致”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

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PDF	R脚本	别致的
PDF		参考手册

细节

biocViews	ChIPSeq,质量控制,软件
版本	1.14.0
Bioconductor自	BioC 3.7 (r - 3.5)(4年)
许可证	GPL-2
取决于	仕达屋优先计划R (> = 3.6)
进口	ChIC.data(> = 1.11.1),caTools、方法、GenomicRanges,IRanges平行,进步,randomForest,脱字符号,统计grDevices跑龙套、图形S4Vectors,BiocGenerics,genomeIntervals,Rsamtools
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构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	ChIC_1.14.0.tar.gz
Windows二进制
macOS 10.13(高山脉)	ChIC_1.14.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/ChIC
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/别致
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/ChIC/
包下载报告	下载数据