这个包是3.14版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅指南针。
Bioconductor版本:3.14
指南针是一个统计框架,使公正分析抗原t细胞的子集。指南针使用贝叶斯层次框架模型所有观察到的cell-subsets并选择最有可能抗原而加快小细胞计数,经常出现在多参数空间。模型提供了一种后验概率每个细胞的特异性的子集,每个样本,可以用于配置主体的外部刺激免疫反应,如感染或接种疫苗。
作者:林林恩,凯文•Ushey格雷格•Finak Ravio Kolde (pheatmap)
维护人员:格雷格Finak < gfinak fhcrc.org >
从内部引用(R,回车引用(“指南针”)
):
安装这个包,开始R(版本“4.1”)并输入:
如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“指南针”)
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查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes(“指南针”)
HTML | R脚本 | 指南针 |
R脚本 | SimpleCOMPASS | |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | FlowCytometry,ImmunoOncology,软件 |
版本 | 1.32.0 |
Bioconductor自 | BioC 2.14 (r - 3.1)(8年) |
许可证 | 艺术- 2.0 |
取决于 | R (> = 3.0.3) |
进口 | 方法,Rcpp,data.table,RColorBrewer,尺度、网格plyr,knitr,abind,线索grDevices跑龙套,pdist,magrittr,reshape2,dplyr,tidyr,rlang,BiocStyle,rmarkdown,foreach,coda |
链接 | Rcpp(> = 0.11.0)它 |
建议 | flowWorkspace(> = 3.33.1),flowCore,ncdfFlow,闪亮的,testthat,devtools,flowWorkspaceData,ggplot2,进步 |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
BugReports | https://github.com/RGLab/COMPASS/issues |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
我的链接 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
源包 | COMPASS_1.32.0.tar.gz |
Windows二进制 | COMPASS_1.32.0.zip(32位和64位) |
macOS 10.13(高山脉) | COMPASS_1.32.0.tgz |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/COMPASS |
源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/指南针 |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/COMPASS/ |
包下载报告 | 下载数据 |