CGHnormaliter

DOI:10.18129 / B9.bioc.CGHnormaliter

这个包是3.14版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅CGHnormaliter。

正常化全息阵列数据与不平衡的畸变。

Bioconductor版本:3.14

归一化和集中化的阵列比较基因组杂交(aCGH)数据。算法使用一个迭代过程的影响,有效地消除了不平衡数字副本。这将导致一个更可靠的评估拷贝数改变(CNAs)。

作者:巴特P.P. van Houte)托马斯·w·Binsl Hannes Hettling

维修工:巴特P.P. van Houte < bvhoute在few.vu.nl >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.1”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“CGHnormaliter”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“CGHnormaliter”)

PDF	R脚本	CGHnormaliter
PDF		参考手册

细节

biocViews	微阵列,预处理,软件
版本	1.48.0
Bioconductor自	BioC 2.5 (r - 2.10)(12.5年)
许可证	GPL (> = 3)
取决于	CGHcall(> = 2.17.0),CGHbase(> = 1.15.0)
进口	Biobase,CGHbase,CGHcall、方法、统计跑龙套
链接
建议
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	CGHnormaliter_1.48.0.tar.gz
Windows二进制	CGHnormaliter_1.48.0.zip
macOS 10.13(高山脉)	CGHnormaliter_1.48.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/CGHnormaliter
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ CGHnormaliter
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/CGHnormaliter/
包下载报告	下载数据