BrainSABER

DOI:10.18129 / B9.bioc.BrainSABER

这个包是3.14版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅BrainSABER。

大脑跨度Atlas Biobase Expressionset R工具集

Bioconductor版本:3.14

艾伦脑科学研究所提供了一种RNA序列(RNA-Seq)数据资源为研究人类大脑发育的转录机制称为BrainSpan。BrainSABER R是一个包,促进了用户数据的比较中发现的各种发展阶段和大脑结构生成动态相似性的热图BrainSpan阿特拉斯的两个数据集。它还提供了一个自我用户数据的容器。

作者:嘉莉云煌岩(aut),普Radichev (aut),生物医学工程(aut (cre)美元

维修工:生物医学工程美元< bicbioeng gmail.com >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.1”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“BrainSABER”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“BrainSABER”)

HTML	R脚本	BrainSABER
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	GeneExpression,测序,软件,可视化
版本	1.4.0
Bioconductor自	BioC 3.12 (r - 4.0)(1.5年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	R (> = 4.1.0),biomaRt,SummarizedExperiment
进口	data.table,文理学院、方法、S4Vectors跑龙套,BiocFileCache,闪亮的
链接
建议	BiocStyle,ComplexHeatmap,fastcluster,的热图,knitr,情节,rmarkdown
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	BrainSABER_1.4.0.tar.gz
Windows二进制	BrainSABER_1.4.0.zip
macOS 10.13(高山脉)	BrainSABER_1.4.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/BrainSABER
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ BrainSABER
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/BrainSABER/
包下载报告	下载数据