BiocSet

DOI:10.18129 / B9.bioc.BiocSet

这个包是3.14版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅BiocSet。

代表不同的生物集

Bioconductor版本:3.14

BiocSet显示不同生物设置三重宠物猫的格式。这三个宠物猫“元素”,“设置”,“elementset”。用户激活方法之一,这三个宠物猫从dplyr包执行常见的功能。映射功能和访问web引用元素/ BiocSet集也可以。

作者:凯拉莫雷尔(aut (cre),马丁•摩根(aut)凯文Rue-Albrecht[所有],Lluis里维拉桑丘(施)

维护人员:凯拉莫雷尔<凯拉。莫雷尔在roswellpark.org >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.1”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“BiocSet”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“BiocSet”)

HTML	R脚本	Tidyverse BiocSet:代表元素集
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	去,GeneExpression,KEGG,软件
版本	1.8.1
Bioconductor自	BioC 3.10 (r - 3.6)(2.5年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	R (> = 3.6),dplyr
进口	方法,宠物猫跑龙套,rlang,plyr,S4Vectors,BiocIO,AnnotationDbi,KEGGREST,ontologyIndex,tidyr
链接
建议	GSEABase,气道,org.Hs.eg.db,DESeq2,limma,BiocFileCache,GO.db,testthat,knitr,rmarkdown,BiocStyle
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我	RegEnrich
进口我	麻雀
建议我	dearseq
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	BiocSet_1.8.1.tar.gz
Windows二进制	BiocSet_1.8.1.zip
macOS 10.13(高山脉)	BiocSet_1.8.1.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/BiocSet
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ BiocSet
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/BiocSet/
包下载报告	下载数据