BiocFileCache

DOI:10.18129 / B9.bioc.BiocFileCache

这个包是3.14版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅BiocFileCache。

跨会话管理文件

Bioconductor版本:3.14

这个包创建一个持久的磁盘缓存的文件,用户可以添加、更新和检索。是有用的管理资源(比如定制Txdb对象)昂贵的或难以创建、跨会话使用web资源和数据文件。

作者:洛里牧羊人(aut (cre),马丁·摩根(aut)

维修工:Lori牧羊人<罗莉。牧羊人在roswellpark.org >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.1”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“BiocFileCache”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“BiocFileCache”)

HTML	R脚本	BiocFileCache:跨会话管理文件资源
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	DataImport,软件
版本	2.2.1
Bioconductor自	BioC 3.5 (r - 3.4)(5年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	R (> = 3.4.0),dbplyr(> = 1.0.0)
进口	方法、统计跑龙套,dplyr,RSQLite,DBI,rappdirs,filelock,旋度,httr
链接
建议	testthat,knitr,BiocStyle,rmarkdown,rtracklayer
SystemRequirements
增强了
URL
BugReports	https://github.com/Bioconductor/BiocFileCache/issues
取决于我	AnnotationHub,ExperimentHub,RcwlPipelines,scATAC.Explorer,TMExplorer
进口我	意大利苦杏酒,atSNP,自治,BayesSpace,BiocPkgTools,biodb,biomaRt,BioPlex,BrainSABER,brendaDb,bugsigdbr,cbaf,cBioPortalData,CellBench,conclus,CTDquerier,customCMPdb,dasper,drugTargetInteractions,easyRNASeq,enhancerHomologSearch,EnrichmentBrowser,EpiTxDb,fgga,GAPGOM,GenomicScores,GenomicSuperSignature,GSEABenchmarkeR,gwascat,杂环胺,MBQN,netDx,NxtIRFcore,NxtIRFdata,奥得河,ontoProc,org.Mxanthus.db,Organism.dplyr,PANTHER.db,psichomics,recount3,recountmethylation,regutools,RiboDiPA,rpx,SingleCellMultiModal,SingscoreAMLMutations,SpatialExperiment,spatialHeatmap,spatialLIBD,TFutils,tximeta,UMI4Cats,uncoverappLib,UniProt.ws,waddR
建议我	AnnotationForge,bambu,BiocOncoTK,BiocSet,chipseqDB,emtdata,火焰,fluentGenomics,HiCDCPlus,HighlyReplicatedRNASeq,HumanTranscriptomeCompendium,MethReg,MethylSeqData,msigdb,Nebulosa,后代,scRNAseq,seqsetvis,simpleSingleCell,structToolbox,TCGAutils,TENxBrainData,TENxPBMCData,TimeSeriesExperiment,zellkonverter
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	BiocFileCache_2.2.1.tar.gz
Windows二进制	BiocFileCache_2.2.1.zip
macOS 10.13(高山脉)	BiocFileCache_2.2.1.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/BiocFileCache
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ BiocFileCache
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/BiocFileCache/
包下载报告	下载数据