此包适用于Bioconductor 3.14版;有关稳定的最新发布版本,请参见BiocCheck.
Bioconductor版本:3.14
执行bioconductor特定的包检查。
作者:Bioconductor Package Maintainer [aut, cre], Lori Shepherd [aut], Daniel von Twisk [ctb], Kevin Rue [ctb], Marcel Ramos [ctb], Leonardo Collado-Torres [ctb], Federico Marini [ctb]
维护者:Bioconductor Package维护者< Maintainer at Bioconductor .org>
引文(从R内,输入引用(“BiocCheck”)
):
要安装此包,请启动R(版本“4.1”)并输入:
如果(!require("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")
对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放.
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“BiocCheck”)
超文本标记语言 | R脚本 | BiocCheck:确保Bioconductor包装指南 |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | 基础设施,软件 |
版本 | 1.30.0 |
在Bioconductor | BioC 2.14 (R-3.1)(8年) |
许可证 | 艺术- 2.0 |
取决于 | R (>= 3.5.0) |
进口 | biocViews(> = 1.33.7),BiocManager,stringdist,图,httr、工具、optparse,codetools,方法,utils,knitr |
链接 | |
建议 | RUnit,BiocGenerics,Biobase,RJSONIO,rmarkdown,devtools(> = 1.4.1),usethis,BiocStyle |
SystemRequirements | |
增强了 | codetoolsBioC |
URL | https://github.com/Bioconductor/BiocCheck/issues |
全靠我 | |
进口我 | AnnotationHubData |
建议我 | GEOfastq,HMP16SData,HMP2Data,packFinder,preciseTAD,scpdata,SpectralTAD |
链接到我 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
源包 | BiocCheck_1.30.0.tar.gz |
Windows二进制 | BiocCheck_1.30.0.zip |
macOS 10.13 (High Sierra) | BiocCheck_1.30.0.tgz |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/BiocCheck |
源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:packages/BiocCheck |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/BiocCheck/ |
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