这个包是3.14版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅BioPlex。
Bioconductor版本:3.14
BioPlex包实现访问BioPlex蛋白质相互作用网络和相关资源在r .除了蛋白质交互网络HEK293和HCT116细胞,这包括乔鲁姆蛋白质复杂的数据访问、和转录组和蛋白质组数据的两个细胞系。功能集中在导入各种数据资源并将它们存储在专用Bioconductor数据结构,作为下游综合基础数据的分析。
作者:路德维希Geistlinger (aut (cre),罗伯特先生(aut)
维护人员:路德维希Geistlinger < ludwig_geistlinger hms.harvard.edu >
从内部引用(R,回车引用(“BioPlex”)
):
安装这个包,开始R(版本“4.1”)并输入:
如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“BioPlex”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (“BioPlex”)
HTML | R脚本 | 1。数据检索 |
HTML | R脚本 | 2。数据检查 |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | DataImport,DataRepresentation,GeneExpression,GraphAndNetwork,MassSpectrometry,网络,蛋白质组学,软件,转录组 |
版本 | 1.0.2中 |
Bioconductor自 | BioC 3.14 (r - 4.1)(< 6个月) |
许可证 | 艺术- 2.0 |
取决于 | R (> = 4.1.0),SummarizedExperiment |
进口 | BiocFileCache,GEOquery,图、方法、跑龙套 |
链接 | |
建议 | AnnotationDbi,AnnotationHub,BiocStyle,ExperimentHub,depmap,knitr,rmarkdown |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | https://github.com/ccb-hms/BioPlex |
BugReports | https://github.com/ccb-hms/BioPlex/issues |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
我的链接 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
源包 | BioPlex_1.0.2.tar.gz |
Windows二进制 | BioPlex_1.0.2.zip |
macOS 10.13(高山脉) | BioPlex_1.0.2.tgz |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/BioPlex |
源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/ BioPlex |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/BioPlex/ |
包下载报告 | 下载数据 |