BioCor

DOI:10.18129 / B9.bioc.BioCor

这个包是3.14版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅BioCor。

功能相似

Bioconductor版本:3.14

计算功能的相似性基础上描述的通路KEGG和REACTOME或基因集。这些相似之处可以计算路径或基因集,基因,或集群和结合其他相似之处。他们可以用来改善网络,基因选择、测试的关系……

作者:Lluis里维拉桑丘(aut (cre),加索尔Sancho-Bru(黑色),Juan Jose Salvatella Lozano(黑色)

维护人员:Lluis里维拉桑丘< Lluis。里维拉在gmail.com >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.1”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“BioCor”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“BioCor”)

HTML	R脚本	关于BioCor
HTML	R脚本	先进的使用BioCor
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文本		新闻
文本		许可证

细节

biocViews	聚类,GeneExpression,网络,NetworkEnrichment,通路,软件,StatisticalMethod,SystemsBiology
版本	1.18.0
Bioconductor自	BioC 3.5 (r - 3.4)(5年)
许可证	麻省理工学院+文件许可证
取决于	R (> = 3.4.0)
进口	BiocParallel,矩阵、方法、GSEABase
链接
建议	reactome.db,org.Hs.eg.db,WGCNA,GOSemSim,testthat,knitr,rmarkdown,BiocStyle,气道,DESeq2,引导,targetscan.Hs.eg.db,Hmisc,拼写
SystemRequirements
增强了
URL	https://llrs.github.io/BioCor/
BugReports	https://github.com/llrs/BioCor/issues
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	BioCor_1.18.0.tar.gz
Windows二进制	BioCor_1.18.0.zip
macOS 10.13(高山脉)	BioCor_1.18.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/BioCor
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ BioCor
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/BioCor/
包下载报告	下载数据