BasicSTARRseq

DOI:10.18129 / B9.bioc.BasicSTARRseq

这个包是3.14版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅BasicSTARRseq。

基本呼吁STARR-seq峰值数据

Bioconductor版本:3.14

基本呼吁STARR-seq峰值数据基于方法中引入“全基因组定量增强活动地图被STARR-seq”阿诺et al。科学。2013年3月1日;339 (6123):1074 - 7。doi: 10.1126 /科学。1232542。Epub 2013年1月17日。

作者:安妮卡方式

维护人员:安妮卡方式<安妮卡。方式在ukmuenster.de >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.1”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“BasicSTARRseq”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

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PDF	R脚本	BasicSTARRseq.pdf
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	报道,FunctionalGenomics,FunctionalPrediction,GeneRegulation,PeakDetection,软件
版本	1.22.0
Bioconductor自	BioC 3.3 (r - 3.3)(6年)
许可证	LGPL-3
取决于	GenomicRanges,GenomicAlignments
进口	S4Vectors、方法、IRanges,GenomeInfoDb,统计数据
链接
建议	knitr
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	BasicSTARRseq_1.22.0.tar.gz
Windows二进制	BasicSTARRseq_1.22.0.zip
macOS 10.13(高山脉)	BasicSTARRseq_1.22.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/BasicSTARRseq
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ BasicSTARRseq
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/BasicSTARRseq/
包下载报告	下载数据