BEclear

DOI:10.18129 / B9.bioc.BEclear

这个包是3.14版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅BEclear。

修正批影响DNA甲基化数据

Bioconductor版本:3.14

提供了批处理函数来检测并纠正影响DNA甲基化数据。核心功能是基于潜在因素模型,也可以用来预测缺失值在任何其他包含实数矩阵。

作者:大卫锉(aut (cre),马库斯·乌鸫(aut) Ruslan Akulenko (aut)

维修工:大卫锉< david.j。粗声粗气地说:gmail.com >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.1”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“BEclear”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“BEclear”)

HTML	R脚本	BEclear教程
PDF		参考手册
文本		新闻
文本		许可证

细节

biocViews	BatchEffect,DNAMethylation,预处理,软件,StatisticalMethod
版本	2.10.0
Bioconductor自	BioC 3.1 (r - 3.2)(7年)
许可证	GPL-3
取决于	BiocParallel(> = 1.14.2)
进口	futile.logger,Rdpack,矩阵,data.table(> = 1.11.8),Rcpp,离群值,abind、统计数据、图形、跑龙套、方法
链接	Rcpp
建议	testthat,BiocStyle,knitr,rmarkdown,老鸨
SystemRequirements	c++ 11
增强了
URL	https://github.com/uds-helms/BEclear
BugReports	https://github.com/uds-helms/BEclear/issues
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	BEclear_2.10.0.tar.gz
Windows二进制	BEclear_2.10.0.zip(32位和64位)
macOS 10.13(高山脉)	BEclear_2.10.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/BEclear
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ BEclear
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/BEclear/
包下载报告	下载数据