AffiXcan

DOI:10.18129 / B9.bioc.AffiXcan

这个包是3.14版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅AffiXcan。

功能的方法来嫁祸于基因调控表达

Bioconductor版本:3.14

归咎于GReX(基因调控表达)一组样品中基因的个体,使用一个方法基于总绑定关联(稍后通知)。统计模型推导出GReX可以训练一个训练数据集,真正的总表达式的值是已知的。

作者:亚历山德罗Lussana (aut (cre)

维护人员:亚历山德罗Lussana <亚历山德罗。在protonmail.com lussana >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.1”)并输入:

如果(!要求(“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“AffiXcan”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“AffiXcan”)

HTML	R脚本	AffiXcan
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	DimensionReduction,GeneExpression,GeneRegulation,PrincipalComponent,回归,软件,转录
版本	1.12.0
Bioconductor自	BioC 3.8 (r - 3.5)(3.5年)
许可证	GPL-3
取决于	R (> = 3.6),SummarizedExperiment
进口	MultiAssayExperiment,BiocParallel,蜡笔
链接
建议	BiocStyle,knitr,rmarkdown
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	AffiXcan_1.12.0.tar.gz
Windows二进制	AffiXcan_1.12.0.zip
macOS 10.13(高山脉)	AffiXcan_1.12.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/AffiXcan
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ AffiXcan
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/AffiXcan/
包下载报告	下载数据