ASpli

DOI:10.18129 / B9.bioc.ASpli

此包适用于Bioconductor 3.14版;有关稳定的最新发布版本，请参见ASpli．

RNA-Seq选择性剪接分析

Bioconductor版本:3.14

使用RNAseq分析替代拼接的综合管道。

作者:埃斯特法尼亚·曼奇尼，安德烈斯·拉宾诺维奇，哈维尔·伊塞尔特，马塞洛·亚诺夫斯基和阿里尔·切尔诺莫雷茨

维护:Estefania Mancini

安装

要安装此包，请启动R(版本“4.1”)并输入:

如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“ASpli”)

PDF	R脚本	ASpli
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	对齐，AlternativeSplicing，报道，DifferentialExpression，DifferentialSplicing，GeneExpression，GenomeAnnotation，ImmunoOncology，RNASeq，测序，软件，TimeCourse，转录
版本	测试盒框
在Bioconductor	BioC 3.4 (R-3.3)(5.5年)
许可证	GPL
取决于	方法，grDevices, stats, utils, parallel，刨边机，limma，AnnotationDbi
进口	GenomicRanges，GenomicFeatures，BiocGenerics，IRanges，GenomicAlignments，Gviz，S4Vectors，Rsamtools，BiocStyle，igraph，htmltools，data.table，UpSetR，tidyr，DT，质量，网格，图形，pbmcapply
链接
建议
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	ASpli_2.4.0.tar.gz
Windows二进制	ASpli_2.4.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra)	ASpli_2.4.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/ASpli
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/ASpli
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/ASpli/
软件包下载报告	下载数据