这个包是3.13版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅liftOver。
Bioconductor版本:3.13
liftOver设施结合UCSC的浏览器开发的轨道基础设施可供农庄格式的数据转换。这是说明一个图像的EBI / NHGRI GWAS目录,截至2017年5月10日,分布式的坐标定义为NCBI hg38建造。
作者:Bioconductor包维护者(aut (cre)
维修工:Bioconductor包维护者<维护者bioconductor.org >
从内部引用(R,回车引用(“liftOver”)
):
安装这个包,开始R(版本“4.1”)并输入:
如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“liftOver”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (“liftOver”)
HTML | R脚本 | 改变基因组与rtracklayer坐标系统::liftOver |
biocViews | BasicWorkflow,工作流 |
版本 | 1.16.0 |
许可证 | 艺术- 2.0 |
取决于 | R (> = 3.3.0),gwascat,GenomicRanges,rtracklayer,Homo.sapiens,BiocGenerics |
进口 | |
链接 | |
建议 | knitr,rmarkdown,BiocStyle |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | //www.anjoumacpherson.com/help/workflows/liftOver/ |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
我的链接 |
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
源包 | liftOver_1.16.0.tar.gz |
Windows二进制 | |
macOS 10.13(高山脉) | |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/liftOver |
源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/ liftOver |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/liftOver/ |
包下载报告 | 下载数据 |