注释

DOI:10.18129 / B9.bioc.annotation

此包适用于Bioconductor 3.13版;有关稳定的最新发布版本,请参见注释

基因组注释资源

Bioconductor版本:3.13

注释资源在Bioconductor项目中占很大比例。此外,还有各种各样的在线资源可供使用,这些资源可以使用特定的软件包访问。本演练将描述这些资源中最流行的,并给出一些关于如何使用它们的高级示例。

作者:Marc RJ Carlson [aut], Herve Pages [aut], Sonali Arora [aut], Valerie Obenchain [aut], Martin Morgan [aut], Bioconductor Package Maintainer [cre]

维护者:Bioconductor Package维护者< Maintainer at Bioconductor .org>

引文(从R内,输入引用(“注释”)):

安装

要安装此包,请启动R(版本“4.1”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") BiocManager::install("annotation")

对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“注释”)

超文本标记语言 R脚本 注释基因组范围
超文本标记语言 R脚本 基因组注释资源

细节

biocViews AnnotationWorkflow工作流
版本 1.16.0
许可证 艺术- 2.0
取决于 R (>= 3.3.0),VariantAnnotationAnnotationHubOrganism.dplyrTxDb.Hsapiens.UCSC.hg19.knownGeneTxDb.Hsapiens.UCSC.hg38.knownGeneTxDb.Mmusculus.UCSC.mm10.ensGeneorg.Hs.eg.dborg.Mm.eg.dbHomo.sapiensBSgenome.Hsapiens.UCSC.hg19biomaRtBSgenomeTxDb.Athaliana.BioMart.plantsmart22
进口
链接
建议 knitrrmarkdownBiocStyle
SystemRequirements
增强了
URL //www.anjoumacpherson.com/help/workflows/annotation/Annotation_Resources/
全靠我
进口我
建议我
链接到我

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包 annotation_1.16.0.tar.gz
Windows二进制
macOS 10.13 (High Sierra)
源库 Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/annotation
源存储库(开发人员访问) Git克隆git@git.bioconductor.org:packages/annotation
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/annotation/
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  • 支持网站-询问有关Bioconductor封装的问题
  • 正常词 邮件列表——供包开发人员使用bob电竞体育官网