生物体工作流套

Bioconductor版本:释放(3.13)

包裹 维护者 标题
注解 Bioconductor包维护者 基因组注释资源
阵列 Bioconductor包维护者 使用生物体进行微阵列分析
Biocmetaworkflow. 迈克史密斯 BIOC工作流程关于发布BIOC工作流程
bp4rnaseq. 山文太阳 保姆用于可重复的RNA-SEQ分析的包装
CageWorkflow. Malte Thodberg. 使用R / Biocumons分析笼数据的逐步指南
chipseqdb. 亚伦伦 用于检测芯片-SEQ数据中差分绑定的生物体工作流程
CsawUsersGuide. 亚伦伦 CSAW用户指南
cytofworkflow. 标记D.罗宾逊 Cytof工作流程:高通量高尺寸细胞计数数据集中的差异发现
EGSEA123 马修里奇 EGSEA简单而有效的合并基因集测试
EQTL. 启用云的CIS-EQTL搜索Biocumon GGTools 5.x
exphuntersuite. 詹姆斯珀金斯 包装转录组数据综合分析
ExpressionNormalizationWorkflow. Karthikeyan Murugesan. 基因表达标准化工作流程
荧光酶学 斯图尔特李 普利人和TXIMETA工作流程
GenereGulation. Bioconductor包维护者 通过序列匹配找到已知转录因子的候选结合位点
Highthrougupatsays Bioconductor包维护者 使用具有高通量测定的生物体
升降机 Bioconductor包维护者 使用rtracklayer ::升降装置改变基因组坐标系
牧师 Stefanie Reisenauer. 使用Affymetrix微阵列的差异基因表达的结束工作流程
甲基疗法arrayAlysis. Jovana Maksimovic 用于分析甲基化阵列数据的交叉包生物体工作流程。
蛋白质组学 Laurent Gatto. 质谱与蛋白质组学数据分析
revountworkflow. Leonardo Collado-Torres 重新计算工作流程:使用Biocumonductor访问超过70,000人RNA-SEQ样品
RNASEQ123 马修里奇 RNA-SEQ分析易于1-2-3,利用氨纶,光明和edger
rnaseqdtu. 迈克尔爱 拨打三文鱼量化后的差分转录物使用的RNA-SEQ工作流程
rnaseqgene. 迈克尔爱 RNA-SEQ工作流程:基因级探索性分析和差异表达
rnaseqgeneedgerql. 云顺陈 基因级RNA-SEQ差异表达和途径分析使用RSUBREAD和Edger准可能性管道
测序 Bioconductor包维护者 Biocumon介绍序列数据
SimpleSingleCell. 亚伦伦 具有Biocumonductor的单单元RNA-SEQ数据的低级分析的逐步工作流程
singscoreamlmutations. Dharmesh D. Bhuva. 使用Singscore从转录组签名中预测AML中的突变
tcgaworkflow. Tiago Chedraoui Silva. TCGA工作流程使用Bioconducts封装分析癌症基因组学和表观囊肿数据
变体 Bioconductor包维护者 注释基因组变体

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