此包适用于Bioconductor 3.13版;有关稳定的最新发布版本,请参见tximportData.
Bioconductor版本:3.13
该包提供了在GEUVADIS项目的一组6个RNA-seq样本上运行各种转录丰度量化器的输出。量词分别是Cufflinks, RSEM, kallisto, Salmon和Sailfish。有关版本号、示例信息和调用细节的详细信息,请参阅包附页。
作者:迈克尔·洛夫
维护者:Michael Love
引文(从R内,输入引用(“tximportData”)
):
要安装此包,请启动R(版本“4.1”)并输入:
如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") BiocManager::install("tximportData")
对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放.
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“tximportData”)
超文本标记语言 | R脚本 | tximport的示例输出文件 |
参考手册 |
biocViews | ExperimentData,RNASeqData,SequencingData |
版本 | 1.20.0 |
许可证 | GPL (>= 2) |
取决于 | |
进口 | |
链接 | |
建议 | knitr,减价 |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
全靠我 | |
进口我 | |
建议我 | crossmeta,DESeq2,鱼池,HumanTranscriptomeCompendium,tximeta,tximport,variancePartition |
链接到我 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
源包 | tximportData_1.20.0.tar.gz |
Windows二进制 | |
macOS 10.13 (High Sierra) | |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/tximportData |
源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:packages/tximportData |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/tximportData/ |
软件包下载报告 | 下载数据 |