纳米管

DOI:10.18129 / B9.bioc.nanotubes

此包适用于Bioconductor 3.13版;有关稳定的最新发布版本,请参见纳米管

小鼠纳米管CAGE数据

Bioconductor版本:3.13

基因表达(CAGE)数据的Cap分析来自Bornholdt等人的“鉴定基因转录起始位点和增强子响应肺碳纳米管暴露在体内”,作为CAGE转录起始位点(ctss)提供。

作者:Malte Thodberg

维护者:Malte Thodberg

引文(从R内,输入引用(“碳纳米管”)):

安装

要安装此包,请启动R(版本“4.1”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“碳纳米管”)

超文本标记语言 R脚本 纳米管
PDF 参考手册

细节

biocViews ExperimentDataExpressionDataSequencingData
版本 1.8.0
许可证 GPL-3
取决于 R (>= 3.6)
进口
链接
建议 knitrrmarkdownBiocStyleGenomicRangesrtracklayerCAGEfightR
SystemRequirements
增强了
URL https://github.com/MalteThodberg/nanotubes
BugReports https://github.com/MalteThodberg/nanotubes/issues
全靠我 CAGEWorkflow
进口我
建议我
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构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包 nanotubes_1.8.0.tar.gz
Windows二进制
macOS 10.13 (High Sierra)
源库 Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/nanotubes
源存储库(开发人员访问) Git克隆git@git.bioconductor.org:packages/nanotubes
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/nanotubes/
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