纳米管

DOI:10.18129 / B9.bioc.nanotubes

此包适用于Bioconductor 3.13版;有关稳定的最新发布版本，请参见纳米管．

小鼠纳米管CAGE数据

Bioconductor版本:3.13

基因表达(CAGE)数据的Cap分析来自Bornholdt等人的“鉴定基因转录起始位点和增强子响应肺碳纳米管暴露在体内”，作为CAGE转录起始位点(ctss)提供。

作者:Malte Thodberg

维护者:Malte Thodberg

安装

要安装此包，请启动R(版本“4.1”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“碳纳米管”)

超文本标记语言	R脚本	纳米管
PDF		参考手册

细节

biocViews	ExperimentData，ExpressionData，SequencingData
版本	1.8.0
许可证	GPL-3
取决于	R (>= 3.6)
进口
链接
建议	knitr，rmarkdown，BiocStyle，GenomicRanges，rtracklayer，CAGEfightR
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/MalteThodberg/nanotubes
BugReports	https://github.com/MalteThodberg/nanotubes/issues
全靠我	CAGEWorkflow
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	nanotubes_1.8.0.tar.gz
Windows二进制
macOS 10.13 (High Sierra)
源库	Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/nanotubes
源存储库(开发人员访问)	Git克隆git@git.bioconductor.org:packages/nanotubes
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/nanotubes/
软件包下载报告	下载数据